圣弗朗索瓦-格扎维埃1506年4月7日出生在那瓦尔的一个贵族家庭，在索邦大学读神学。在索邦大学，他遇到了耶稣会的创始人Ignace De Loyola。他参加了1534年耶稣会的建立。

热衷于传教，他1537年被授予神甫称号并1541年4月7日出发前往印度，1542年5月6日到达果阿。

几次旅行后，传教士1552年4月17日重新出海，目的地中国。他1552年9月到达现在的广东上川岛，离中国海岸线澳门约十公里。他试着联系过几个船工，想偷渡到广州，但没成功。事实上，那个时代，他不可能进入中国。

1552年11月21日，格扎维埃神甫做他的最后一次弥撒。走下祭台，他感到筋疲力尽。他试着出海，但船的横摇已破损。回到上川岛，他在那里度过了一生的最后几天，于1552年12月3日去世。1622年5月12日，圣弗朗索瓦-格扎维埃和Ignace De Loyola同时被罗马教皇格雷古瓦十五世封为圣人。